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羅丹明標記鬼筆環(huán)肽(橙紅）是從致命的傘形毒蕈蘑菇中分離出來的一種毒素。它是特異性結(jié)合于 F-肌動蛋白的雙環(huán)肽。因此用熒光染料標記的鬼筆環(huán)肽可以非常方便的研究 F-肌動蛋白的分布。鬼筆環(huán)肽內(nèi)部，在半胱氨酸和色氨酸之間含有不常見的硫醚橋形成內(nèi)環(huán)結(jié)構(gòu)。在pH 升高時，該硫醚被裂解，鬼筆環(huán)肽失去對肌動蛋白的親和力。

JC-1 線粒體膜電位熒光探針 是一種廣泛用于檢測線粒體膜電位△Ψ m 的理想熒光探針?？梢詸z測細胞、組織或純化的線粒體膜電位。在線粒體膜電位較高時，JC-1 聚集在線粒體的基質(zhì)中，形成聚合物，可以產(chǎn)生紅色熒光

碘化丙啶（Propidium Iodide，PI）是一種常用的細胞核熒光染料，作為一種溴化乙錠（EB）的類似物，能夠嵌入堿基之間實現(xiàn)與DNA結(jié)合。這種結(jié)合沒有或者幾乎無序列傾向性，大約每4-5個DNA堿基對結(jié)合一個染料。PI也能與RNA結(jié)合，需要用核酸酶處理來區(qū)分DNA和RNA染色。

羅丹明 123是一種常用的陽離子綠色熒光染料，可以透過細胞膜從而在活細胞線粒體內(nèi)聚集，并發(fā)出黃綠色熒光，可廣泛用于檢測線粒體膜電位，并且對細胞沒有任何毒性，另外，Rh12與常規(guī)蛋白染料 PE-Cy5 和AMCA(7-amino-4-methyl coumarin-3-acetic acid)等沒有熒光干 擾，因此可用于多標實驗。

磺酰羅丹明B是一種高度水溶性，非固定的紅色熒光極性示蹤劑，用于細胞形態(tài)調(diào)查、熒光脂質(zhì)體制備、細胞-細胞間通信研究和接下來的吞噬體-溶酶體攝取和融合。