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分子生物學(xué)試劑
PCR相關(guān)
T12112xLab SuperHiFi PCR Master Mix
product
產(chǎn)品分類(lèi)品牌 | LABLEAD | 貨號(hào) | T1211 |
---|---|---|---|
供貨周期 | 一周 |
2xLab SuperHiFi PCR Master Mix
貨號(hào):T1211
儲(chǔ)存條件:-20℃
產(chǎn)品組成:
組分 | 規(guī)格 S | 規(guī)格 M | 規(guī)格 L |
2× Lab SuperHF PCR Master Mix | 1 ml | 5×1 ml | 20×1 ml |
2.5× PCR Enhancer | 1 ml | 1 ml | 5×1 ml |
2xLab SuperHiFi PCR Master Mix
產(chǎn)品簡(jiǎn)介:
2× Lab SuperHF PCR Master Mix是即用型2×預(yù)混合溶液,包含Lab Super High-Fidelity DNA Polymerase、dNTPs 和精心優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液,只需加入模板、引物和水即可進(jìn)行高保真PCR反應(yīng)。本產(chǎn)品適用于以基因組DNA、cDNA、質(zhì)粒以及粗品為模板的PCR反應(yīng)。
產(chǎn)品特點(diǎn):
1. 保真度高,擴(kuò)增速度快:保真度是普通Taq酶的70倍,擴(kuò)增速度是Pfu的5倍。
2. 擴(kuò)增片段長(zhǎng)度長(zhǎng):使用λDNA、質(zhì)粒等簡(jiǎn)單模板時(shí),可以輕松擴(kuò)增長(zhǎng)達(dá)20 kb的片段;而使用基因組DNA等復(fù)雜模板時(shí),能有效擴(kuò)增長(zhǎng)達(dá)12 kb的片段。
3. 2× Lab SuperHF PCR Master Mix對(duì)PCR抑制劑具有良好的耐受能力,對(duì)粗提樣本也能進(jìn)行很好的擴(kuò)增。
反應(yīng)體系: 模板用量:
試劑 | 使用量 |
2× Lab SuperHF PCR Master Mix | 25 μl |
2.5× PCR Enhancer(可選) | 20 μla |
上游引物 (10 μM) | 1 μl |
下游引物 (10 μM) | 1 μl |
模板 | x μl |
ddH2O | Up to 50 μl |
模板種類(lèi) | 推薦用量 |
基因組DNA | 10~200 ng |
質(zhì)?;虿《綝NA | 10 pg~50 ng |
cDNA | 1~5 μl (不超過(guò)PCR反應(yīng)總體積的1/10) |
粗品 | 1~5 μl (不超過(guò)PCR反應(yīng)總體積的1/10) |
a. 當(dāng)擴(kuò)增片段 GC 含量 >60% 且優(yōu)化條件也無(wú)法正常擴(kuò)增時(shí),推薦使用 2.5×PCR Enhancer來(lái)優(yōu)化 PCR 反應(yīng)。程序推薦:Touchdown PCR(降落 PCR)程序。
反應(yīng)程序:
①三步法:
步驟 | 溫度 | 時(shí)間 | 循環(huán)數(shù) |
預(yù)變性b | 95oC | 3-5 min | 1 |
變性 | 95oC | 10 s |
30-35 |
退火c | 55~72oC | 15s | |
延伸d | 72oC | 30 s/ kb | |
終延伸 | 72oC | 5 min | 1 |
4-8oC | Hold |
b. 對(duì)于普通模板,預(yù)變性可縮短至30~60 s;對(duì)于復(fù)雜模板,例如高 GC 序列,推薦延長(zhǎng)預(yù)變性時(shí)間到3~5 min 以充分變性;
c. 根據(jù)引物 Tm 值設(shè)置退火溫度。如引物Tm值≥72℃,可刪除退火步驟,直接進(jìn)行后續(xù)的延伸步驟(兩步法PCR)。如果需要,可以建立一個(gè)溫度梯度尋找引物與模板結(jié)合的最適溫度。此外,退火溫度直接決定擴(kuò)增特異性。如發(fā)現(xiàn)擴(kuò)增特異性差,可適當(dāng)提高退火溫度;
d. 對(duì)于大多數(shù)模板,30s/kb即可有效擴(kuò)增; 對(duì)于一些復(fù)雜模板,可延長(zhǎng)延伸時(shí)間至30~60 s/kb。
②兩步法e:
步驟 | 溫度 | 時(shí)間 | 循環(huán)數(shù) |
預(yù)變性 | 95oC | 3-5 min | 1 |
變性 | 95oC | 10 s | 30-35 |
退火&延伸 | 65~68oC | 30 s/ kb | |
終延伸 | 72oC | 5 min | 1 |
4-8oC | Hold |
e. 通常情況下使用兩步法和三步法進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增,性能無(wú)顯著差異,可以根據(jù)操作習(xí)慣自行選擇。但對(duì)于一些復(fù)雜模板(如長(zhǎng)片段,Tm 分布不均勻,特殊結(jié)構(gòu)模板),可以嘗試兩步法或Touchdown PCR(降落PCR)法。此外,使用質(zhì)粒為模板進(jìn)行點(diǎn)突變時(shí),也建議使用兩步法。
③Touchdown PCR(降落 PCR)f法:
步驟 | 溫度 | 時(shí)間 | 循環(huán)數(shù) |
預(yù)變性 | 95oC | 3-5 min | 1 |
變性 | 95oC | 10 s |
30-40 |
退火 | 68℃ (-0.2℃/cycle) | 15s | |
延伸 | 72oC | 30 s/ kb | |
終延伸 | 72oC | 5 min | 1 |
4-8oC | Hold |
f. 該程序僅供參考,Touchdown PCR (降落PCR)有多種程序可靈活調(diào)整,請(qǐng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求與習(xí)慣自行決定是否采用。
注意事項(xiàng):
1. 請(qǐng)不要使用含尿mi啶的引物和模板。
2. Lab Super High-Fidelity DNA Polymerase具有較強(qiáng)的校正活性,產(chǎn)生的擴(kuò)增產(chǎn)物是平末端,如果用于下一步克隆實(shí)驗(yàn),建議使用平末端克隆。如果擴(kuò)增產(chǎn)物需要用于TA克隆,加A之前須先進(jìn)行DNA純化。
3. 為了提高擴(kuò)增成功率和產(chǎn)量,請(qǐng)使用高質(zhì)量的模板。
常見(jiàn)問(wèn)題:
問(wèn)題描述 | 可能原因 | 解決辦法 |
無(wú)產(chǎn)物或產(chǎn)物量少 | 引物 | 優(yōu)化引物設(shè)計(jì) |
退火溫度 | 設(shè)置退火溫度梯度,找到合適的退火溫度 | |
引物濃度 | 適當(dāng)提高引物濃度 | |
延伸時(shí)間 | 適當(dāng)增加延伸時(shí)間至 30~60 s/kb | |
循環(huán)數(shù) | 增加循環(huán)數(shù)至 36~40 個(gè)循環(huán) | |
模板純度 | 使用高純度模板 | |
模板使用量 | 使用量參照反應(yīng)體系推薦量調(diào)整并適當(dāng)增加 | |
有雜帶或彌散條帶 | 引物 | 優(yōu)化引物設(shè)計(jì) |
退火溫度 | 嘗試提高退火溫度并設(shè)置退火溫度梯度 | |
引物濃度 | 適當(dāng)降低引物濃度 | |
循環(huán)數(shù) | 減少循環(huán)數(shù)至 25~30 個(gè)循環(huán) | |
模板純度 | 使用高純度模板 | |
模板使用量 | 使用量參照反應(yīng)體系推薦量調(diào)整并適當(dāng)減少 |
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